Haplogrupo R (ADNmt) - Haplogroup R (mtDNA)

*Haplogrupo R*
Haplogrupo R
Posible hora de origen	66,8 ± 14,2 kya
Posible lugar de origen	Asia meridional Asia sudoriental
Antepasado	norte
Descendientes	R0 , R1, R1b , R2'JT , R3, R5, R6'7, R8, R9, R11 ' B , R12'21, R14, R22, R23, R30, R31, P , U
Definición de mutaciones	12705, 16223

El haplogrupo R es un haplogrupo de ADN mitocondrial humano (ADNmt) ampliamente distribuido . El haplogrupo R está asociado con el poblamiento de Eurasia hace unos 70.000 años y se distribuye en las poblaciones modernas de todo el mundo fuera del África subsahariana .

Haplogrupo R es un descendiente de la macro- haplogrupo N . Entre los haplogrupos descendientes del clado R se encuentran B , U (y por tanto K ), F , R0 (y por tanto HV , H y V ) y JT (el haplogrupo ancestral de J y T ).

Origen

Soares y col. (2009) estiman la edad del haplogrupo R en66,8 ± 14,2 kya ( IC del 95% ), es decir, hace aproximadamente entre 80.000 y 50.000 años, con una edad más probable cercana a los 65.000 años.

Esto es coherente con un surgimiento en el curso de la migración costera desde África oriental hacia Asia occidental, meridional y sudoriental. Se ha sugerido que el linaje temprano de los haplogrupos M, N y R a lo largo de la ruta costera durante el período de aproximadamente 70.000 a 60.000 años atrás.

El haplogrupo R tiene una amplia diversidad y antigüedad en la población indígena del sur de Asia. Las tribus y castas del oeste y sur de la India muestran una mayor diversidad que las otras regiones, lo que posiblemente sugiere su estatus autóctono. Larruga y col. (2017) encontraron que el mtDNA R se extendía a Eurasia y Australia desde un área central a lo largo de la costa del sudeste asiático. El fósil del hombre Ust'-Ishim de Siberia, fechado ca. 45.000 años, pertenece al haplogrupo R * (antes clasificado como U *).

Distribución

El haplogrupo R y sus descendientes se distribuyen por toda Australasia , América , el sudeste de Asia , el sur de Asia , Asia central , Asia occidental , Asia oriental , Europa , África del Norte y el Cuerno de África .

El clado R * basal se encuentra entre los Soqotri (1,2%), así como en el noreste de África (1,5%), Oriente Medio (0,8%), Oriente Próximo (0,8%) y la península arábiga (0,3%). .

También se ha observado el haplogrupo R entre las momias egipcias excavadas en el sitio arqueológico de Abusir el-Meleq en el norte de Egipto, que datan de los períodos Preptolemaico / Imperio Nuevo tardío , Ptolemaico y Romano .

El subclade R2 se observó en los restos de un ser humano neolítico del oeste de Irán en Tepe Abdul Hosein.

Subclades

Haplogrupo R
- R0 o pre-HV
  - R0a o (preHV) 1: Ocurre comúnmente en la península arábiga, y su frecuencia más alta se observa entre los soqotri. Frecuencias moderadas que se encuentran en el norte de África , el Cuerno de África y Asia Central .
  - HV: Es un haplogrupo de Eurasia occidental que se encuentra principalmente en todo el Medio Oriente , incluido Irán . También se encuentra en el norte de África , Asia central y el sur de Asia .
    - - V : Se encuentra en frecuencias moderadamente bajas en toda Europa; la frecuencia más alta está en el pueblo Sami 40%.
    - HV1: principalmente en Oriente Medio .
    - HV2: principalmente en el sur de Asia .
    - HV3: principalmente en Europa del Este .
    - H: En el oeste de Eurasia . Es el haplogrupo de ADNmt más común en Europa .
- R1
  - - R1a * (3337): Encontrado en brahmanes de Uttar Pradesh (India).
    - R1a1: Se encuentra en personas del noroeste del Cáucaso como Kabardins y Adygei . Observado en poblaciones de Europa del Este como el noroeste de Rusia y los polacos .
    - R1b: Observado en un cazador recolector oriental de Karelia, Rusia, fechado en el 5500 a. C.
      - R1b1: Observado en Bulgaria, Armenia (incluido un espécimen antiguo) e India
        
        R1b1a: observado en uigures
        
        R1b1b: Observado en Finlandia (incluidos los suecos de Finlandia )
      - R1b2
        
        R1b2a: Observado en Yakuts
        
        R1b2b: observado en uigures
- pre-JT o R2'JT
  - R2 : Se encuentra principalmente en Baluchistán (Pakistán) .
    - (13500): Encontrado en Rajasthan y Uttar Pradesh (India).
    - (150, 303 + 1C): En Irán , Georgia y Turquía .
  - JT
    - J: La frecuencia más alta se encuentra en el Cercano Oriente (12%), el 21% en Arabia Saudita . J desciende hacia Europa en un 11%, el Cáucaso en un 8%, el norte de África en un 6% y prácticamente desaparece en el este de Asia.
    - T: La frecuencia más alta se encuentra en la región del Caspio ( Cáucaso , norte de Irán , Turkmenistán ). Es importante en Europa (casi un 10%), Oriente Medio , Asia Central , Pakistán y África del Norte . Pequeña frecuencia en el Cuerno de África e India .
- R3 : Encontrado en Armenia. También se observa en un individuo antiguo de Hungría , que data de hace 7000 años.
- R5 : Ampliamente extendido en el subcontinente indio . Especialmente en Madhya Pradesh ( India ) al 17%.
  - R5a
    - R5a1: Se encuentra en las poblaciones de habla indoeuropea de la India .
    - R5a2: Especialmente entre los grupos dravídicos de India y Sri Lanka .
- R6'7 (16362) La presencia más importante se da entre los hablantes de lengua austroasiática de la India (10%).
  - R6 : Las pequeñas frecuencias en la India y Pakistán se encuentran de manera prominente en las poblaciones de Tamil y Cachemira .
  - R7 : En el subcontinente indio .
    - R7a: principalmente en el este de la India , especialmente en Santals de Bihar y Jharkhand .
    - R7b: Especialmente en tribus dravídicas de la India oriental .
- R8 : La frecuencia más alta ocurre hacia el este de la India , especialmente dentro de Orissa (12%), y se encuentra entre las tribus austroasiáticas ( hablantes de munda y khasi ). También está presente en baja frecuencia entre hablantes de dravidiano, indoeuropeo y tibeto-birmano ( por ejemplo , Nyishi , Changpa , Sherpa
  ).
  - R8a: Se encuentra principalmente en Orissa y Andhra Pradesh (India).
  - R8b: en Orissa , Gujarat , Andhra Pradesh (India).
- R9 (16304)
  - R9b: Aparece principalmente en el sudeste asiático . Se encuentra en toda Indonesia , en Indochina , Malasia , en malayos aborígenes como Semelai al 28% y Temuan al 21%.
  - (249d)
    - R9c: En todo el archipiélago malayo y Taiwán . Principalmente en Batak ( Palawan ) con un 58%, Tsou de Taiwán (22,9%) y Alor (Indonesia) con un 11%.
    - F: bastante común en el este de Asia y el sudeste asiático . Las frecuencias más altas ocurren en algunas áreas como Nicobar al 50% y Arunachal Pradesh al 31% ( India ), y lagente de Shors de Siberia al 44%. También hay una frecuencia importante en aborígenes taiwaneses , Guangdong (China), Maluku (Indonesia), Tailandia y Vietnam .
- R11'B (16189)
  - R11 : Se encuentra en China , principalmente en personas Lahu de Yunnan al 12,5%. También en Japón , Corea , Chams y Rajasthan (India).
  - B
    - B4: Se encuentra a menudo en el este de Asia , el sudeste de Asia , Polinesia , Melanesia , Micronesia , Madagascar y pueblos indígenas de las Américas .
    - B5: Propagación en el este de Asia y el sudeste de Asia .
  - R24 : Encontrado en Filipinas .
- R12'21
  - R12 : Encontrado en Australia .
  - R21 : En los pueblos indígenas de Malasia como Jahai Negritos en un 63% y Senoi en un 37%, así como en los Maniq del sur de Tailandia y en algunos otros individuos tailandeses y malasios .
- R14 : Se encuentra en Papúa Nueva Guinea y en hablantes austronesios de Timor Oriental y Lembata .
- R22 o R12: Muy frecuente en Shompen (10/29 = 34,5%). En otros lugares se encuentra principalmente en el centro-sur de Indonesia (11,4% Mataram , 8,0% Waingapu , 7,3% Bali , 1,9% Borneo ) y en Cham de Bình Thuận , Vietnam (7/168 = 4,2%), con ocurrencias únicas o esporádicas en Tailandia , Sumatra , Java , Sulawesi y Alor .
- R23 : Pequeño clado encontrado en Bali y Sumba (Indonesia).
- R30
  - R30a: Se encuentra en Andhra Pradesh , Uttar Pradesh (India), en el pueblo Tharu de Nepal y en el pueblo Sinhalese de Sri Lanka .
  - R30b: Encontrado en Punjab .
  - R30 * (1598, 16189): Encontrado en Punjab , Nepal y Japón .
- R31
  - R31a: En brahmanes de Uttar Pradesh y Rajputs de Rajasthan (India).
  - R31b: en Reddys de Andhra Pradesh (India).
- R32

Encontrado en Mauricio

- P: Es característico de Sahul . Encontrado en Filipinas e Indonesia Oriental.
  - (16176)
    - P1: generalizado en Melanesia . Las frecuencias más altas ocurren en Papua Nueva Guinea . También se encuentra en Maluku , Nusa Tenggara y Polinesia .
    - P2'10
      - P2: En Melanesia , especialmente en Nueva Guinea y Nueva Caledonia .
      - P10: Encontrado en Filipinas .
    - P9 (o AuE): en aborígenes australianos de la región central.
  - P3: En Australia y Melanesia .
  - P4: En Australia y Melanesia .
- U
  - U1: Aparece principalmente en Oriente Medio y el Cáucaso . Se encuentra desde la India hasta el Mediterráneo y el resto de Europa.
  - U5: Aproximadamente el 11% del total de europeos y el 10% de los europeos-estadounidenses. La frecuencia más alta se encuentra en el pueblo Sami .
  - U6: Es común en el norte de África y el Cuerno de África , especialmente en el Magreb . Las frecuencias más altas del subclade ocurren entre los bereberes argelinos (29%) y los coptos egipcios (27,6%). El U6 también se ha encontrado entre los ejemplares de Iberomaurusianos que datan del Epipaleolítico en el yacimiento prehistórico de Taforalt .
  - U2'3'4'7'8'9 (1811): Ampliamente extendido en Eurasia occidental y el subcontinente indio .
    - U8
      - K

Árbol

Este árbol filogenético de los subclades del haplogrupo R se basa en el artículo de Mannis van Oven y Manfred Kayser. Árbol filogenético completo actualizado de la variación global del ADN mitocondrial humano y la investigación posterior publicada.

R
- R0 (anteriormente pre-HV)
  - R0a
    - R0a1
    - R0a2
  - HV
    - HV0 (anteriormente pre-V)
      - HV0a
        V
    - H
- R1
  - R1a
    - R1a1
      - R1a1a
- R2'JT
  - R2
  - JT
    - J
    - T
- R5
  - R5a
    - R5a1
      - R5a1a
    - R5a2
      - R5a2a
      - R5a2b
        
        R5a2b1
        
        R5a2b2
        
        R5a2b3
        
        R5a2b4
- R6'7
  - R6
    - R6a
      - R6a1
        R6a1a
  - R7
    - R7a
      - R7a1
        
        R7a1a
        
        R7a1b
        
        R7a1b1
        
        R7a1b2
    - R7b
      - R7b1
        R7b1a
- R8 - India
  - R8a - Sri Lanka
    - R8a1
      - R8a1a
        
        R8a1a1
        
        R8a1a2
        
        R8a1a3 - Sudáfrica, Noruega
      - R8a1b
    - R8a2
  - R8b
    - R8b1
    - R8b2
- (16304)
  - R9
    - R9b - Camboya, Tailandia ( Lao Isan en la provincia de Ubon Ratchathani y la provincia de Roi Et ), Guinea
      - R9b1 - China, uigur, Tailandia ( lunes en el centro de Tailandia , tailandés en el oeste de Tailandia ), Laos ( Lao en Vientiane ), Vietnam ( La Hủ ), Dinamarca
        
        R9b1a
        
        R9b1a1 - Filipinas ( Mamanwa )
        R9b1a1a - China, Tailandia ( Karen y Thai Lue en el norte de Tailandia , Lao Isan en la provincia de Roi Et , Thai en el centro de Tailandia y el este de Tailandia ), Camboya ( Banteay Meanchey ), Malasia ( Semelai , aborigen malayo ), Singapur, Indonesia ( Tengger , Palembang , Padang , Manado ), Vietnam ( Giarai )
        
        R9b1a2 - Taiwán ( Tsou ), Tailandia ( Lao Isan en la provincia de Loei , tailandés en Tailandia occidental )
        
        R9b1a2a - China (Han de Tai'an , etc. ), Vietnam ( Tay , etc. ), Rusia ( Tubalar )
        
        R9b1a2b - China, Taiwán (Minnan, Hakka), Vietnam ( Tay ), Tailandia ( Khon Mueang de la provincia de Chiang Rai , Tai Khuen del norte de Tailandia)
        
        R9b1a3 - Tailandia, China ( Han , Dai ), Vietnam ( Dao , Nùng , etc. ), Kazajstán
        
        R9b1b - China, Vietnam, Camboya ( Siem Reap ), Tailandia ( Khon Mueang de la provincia de Chiang Mai , Tai Yuan de Tailandia central , Mon de Tailandia del norte )
      - R9b2 - Tailandia, Camboya, Vietnam
    - R9c - China (Barghut de Hulun Buir ), Taiwán
      - R9c1
        
        R9c1a - Filipinas, Indonesia, Taiwán ( Makatao ), Tailandia ( Khon Mueang de la provincia de Chiang Rai )
        
        R9c1a1 - Taiwán ( Makatao , rukai , puyuma , etc. ), Guam
        
        R9c1a2 - Taiwán ( Tsou , Bunun )
        
        R9c1a3 - Filipinas ( Batak de Palawan )
        
        R9c1b
        
        R9c1b1 - China ( Han ), Vietnam ( Kinh , Dao ), Tailandia ( presa de Tai en la provincia de Kanchanaburi , Khon Mueang en la provincia de Mae Hong Son , Tai Yuan en el norte de Tailandia , Thai Lue en el norte de Tailandia ), Myanmar
        
        R9c1b2 - Tailandia ( Khon Mueang en la provincia de Chiang Rai ), Taiwán ( Makatao , etc. ), Filipinas ( Ifugao , Bugkalot ), Timor Oriental
    - F
    - R22
- R11'B (16189)
  - R11
    - R11a
  - B
  - R24
- R12'21
  - R12
  - R21
- R22
- R14
- R23
- R30
  - R30a
  - R30b
    - R30b1
- R31
  - R31a
    - R31a1
  - R31b
- R32
- PAG
- U