Lista de bases de datos de neurociencia - List of neuroscience databases
Se encuentran disponibles varias bases de datos de neurociencia en línea que brindan información sobre la expresión génica , las neuronas , la estructura macroscópica del cerebro y los trastornos neurológicos o psiquiátricos . Algunas bases de datos contienen datos descriptivos y numéricos, algunas sobre la función cerebral, otras ofrecen acceso a datos de imágenes "sin procesar", como secciones cerebrales post mortem o imágenes de resonancia magnética 3D y resonancia magnética funcional . Algunos se centran en el cerebro humano, otros en los no humanos.
A medida que ha aumentado el número de bases de datos que buscan difundir información sobre la estructura, el desarrollo y la función del cerebro, también lo ha hecho la necesidad de recopilar estos recursos por sí mismos. Como resultado, ahora existen bases de datos de neurociencias, algunas de las cuales llegan a más de 3000 entradas.
Bases de datos de neurociencia
| Nombre | Descripción | Organismo | Nivel (gen, neurona, macroscópico) | Datos (resonancia magnética, resonancia magnética funcional, imágenes, descriptivos, numéricos) | Trastorno | ¿Registrarse para ver los datos? | Árbitro. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Atlas del cerebro de Allen | Atlas, secciones teñidas de cerebros que muestran el desarrollo y la expresión génica | Ratón, Humano | Macroscópico, Gen | Imagenes | Saludable | No | ||
| Iniciativa de neuroimagen de la enfermedad de Alzheimer (ADNI) | Imágenes de resonancia magnética estructural | Humano | Macroscópico | Conjuntos de datos de resonancia magnética | Enfermedad sana y de Alzheimer | sí | ||
| Cerebro grande | Reconstrucción en 3D del cerebro completo a partir de secciones de histología teñidas del cuerpo celular con una resolución isotrópica de 20 micrones | Humano | Microscópico | Imagenes | Saludable | No | ||
| Datos de BIRN fMRI y MRI | fMRI, resonancias magnéticas y atlas para cerebros humanos y de ratón | Ratón, Humano | Multinivel: regiones cerebrales, conexiones, neuronas, patrones de expresión génica | Conjuntos de datos de resonancia magnética, conjuntos de datos de resonancia magnética funcional | Saludable, Anciano | No | ||
| Base de datos de neuroimágenes del trastorno bipolar | Metaanálisis y base de datos de estudios de resonancia magnética | Humano | Macroscópico | Descriptivo, numérico | Trastorno bipolar | No | ||
| Sistema de gestión de arquitectura cerebral | Recurso en línea para obtener información sobre circuitos neuronales | Rata, ratón, humano | Multinivel: regiones cerebrales, conexiones, neuronas, patrones de expresión génica | Descriptivo, numérico | Saludable | No | ||
| Nube de cerebro | Expresión genética en la corteza prefrontal humana | Humano | Patrones de expresión genética | Descriptivo, numérico | Saludable | No | ||
| CÓDIGO Cerebro | Una plataforma multimodal y de trastornos cruzados para la investigación y los datos integrados de neurociencia del Ontario Brain Institute . | Humano, Animal | Conjuntos de datos multimodales (clínicos, de imágenes, moleculares, etc.) | Descriptivo, numérico, imaginológico, molecular, genético | Neurodesarrollo, parálisis cerebral, epilepsia, depresión, neurodegeneración, conmoción cerebral | sí | ||
| Brain-Development.org | Imágenes de resonancia magnética estructural y atlas | Humano | Macroscópico | Conjuntos de datos de resonancia magnética | Fetos, recién nacidos sanos y prematuros | sí | ||
| Braingraph.org | Braingraphs calculados a partir de los datos del Proyecto Human Connectome | Humano | Macroscópico, hasta 1015 nodos | gráficos dirigidos y no dirigidos en formato GraphML anotado anatómicamente | Saludable | No | ||
| Braininfo | Atlas, atlas esquemático de Macaca fascicularis | Macaco | Macroscópico | Imágenes esquemáticas | Saludable | sí | ||
| Plataforma de interfaz cerebro-máquina | Diferentes tipos de datos relacionados con la interfaz cerebro-máquina. | Humano, mono | Macroscópico, neurona | Imágenes, numéricas | Saludable | No | ||
| BrainMap.org | base de datos de coordenadas fMRI | Humano | Macroscópico | Descriptivo | Saludable | sí | ||
| BrainMaps | Atlas, cortes de cerebros teñidos de alta resolución | Humanos, primates y no primates (14 especies en total) | Neurona y macroscópico | Imagenes | Saludable | No | ||
| Portal de datos de Brain / MINDS | Atlas, exploraciones de resonancia magnética in-vivo y ex-vivo, grabaciones de ECoG | Tití común, humano | Macroscópico | Imagenes | Saludable | No | ||
| Base de datos Brede | Base de datos de coordenadas de fMRI y PET | Humano | Macroscópico | Descriptivo | Saludable | No | ||
| Brainmuseum.org / MSU Brain Biodiversity Bank | Atlas, cortes teñidos de cerebros e imágenes de resonancia magnética | Humanos y otras 62 especies | Macroscópico | Imagenes | Saludable | No | ||
| Brainomics / Localizador | Exploraciones de resonancia magnética funcional y resonancia magnética, datos de comportamiento | Humano | Macroscópico | Imágenes, numéricas | Saludable | No | ||
| Atlas subcortical de Caltech | Resonancias magnéticas | Humano | Macroscópico | Resonancia magnética | Saludable | No | ||
| Centro de Cambridge para el Envejecimiento y la Neurociencia (Cam-CAN) | Resonancia magnética, resonancia magnética funcional, datos de MEG para ~ 700 adultos sanos derivados de la población de entre 18 y 88 años | Humano | Macroscópico | Imágenes, descriptivas, numéricas | Saludable | No | ||
| El archivo de imágenes del cáncer | Imágenes por resonancia magnética, tomografía computarizada y PET de pacientes con cáncer con datos clínicos de respaldo (en muchos casos) | Humano | Macroscópico | Imágenes, descriptivas, numéricas | Cáncer | No | ||
| Base de datos de transcriptomas de desarrollo cerebeloso | Atlas, secciones teñidas de cerebros de ratones que muestran el desarrollo cerebeloso y la expresión génica | Ratón | Macroscópico, Gen | Imagenes | Saludable | No | ||
| Investigación colaborativa en neurociencia computacional CRCNS.org | Muchos tipos de resultados de neurociencia que son relevantes para el modelado. | Humanos y varias otras especies | Multiescala | Trenes de clavos, LFP, MUA, MRI | Saludable | sí | ||
| Base de datos para alcanzar experimentos y modelos (DREAM) | Alcanzar datos (comportamiento, generalización, adaptación, aprendizaje, pico, fMRI, incertidumbre) | Humano y mono | Macroscópico | Cinemática, pico, fMRI | Saludable | sí | ||
| El centro de datos de fMRI | Conjuntos de datos de resonancia magnética funcional de estudios publicados | Humano | Macroscópico | Conjuntos de datos de fMRI | Saludable | sí | ||
| Proyecto GLIMPS (imagen de glucosa en los síndromes parkinsonianos) | Base de datos internacional de enfermedades neurodegenerativas por tomografía FDG-PET | Humano | Macroscópico | Imágenes de FDG-PET | Enfermedad de Parkinson (EP), enfermedad de Alzheimer (EA), atrofia multisistémica (MSA), parálisis supranuclear progresiva (PSP), etc. | sí | ||
| Portal del hipocampo | Circuitos, tipos neurales, electrofisiología | Humano adulto | Neurona | Morfología celular, electrofisiología, composición de regiones, conectividad | Saludable | sí | ||
| Base de datos internacional de electrofisiología de la epilepsia (IEEG.org) | EEG, metadatos, imágenes, anotaciones en los datos | Modelos humanos y animales de epilepsia | EEG, campos locales, micro-ECoG | Electrofisiología | No saludable, varios saludables | sí | ||
| Iniciativa internacional de intercambio de datos de neuroimagen (INDI) | Datos de conectividad funcional de muchos grupos diferentes | Invertebrados (47 especies en total) | Macroscópico | Conectividad funcional | Saludable, no saludable | sí | ||
| Plataforma de cerebro de invertebrados | Fotos de disecciones del sistema nervioso de invertebrados. | Invertebrados (47 especies en total) | Macroscópico | Fotos | Saludable | No | ||
| Fantasma humano in vivo | Datos de resonancia magnética de ultra alta resolución de un solo participante, incluida angiografía ToF de 150 μm, MPRAGE ponderado en T1 de 250 μm, QSM de 330 μm, TSE ponderado en T2 de 450 μm, DTI de 800 μm, una hora continua de 1,8 mm rs-fMRI y datos estructurales adquiridos a lo largo de más más de una década | Humano | Mesoscópico | Resonancia magnética estructural con varios contrastes, resonancia magnética de microestructura y resonancia magnética funcional | Saludable | No | ||
| Atlas de JuBrain | Mapas 3D citoarquitectónicos probabilísticos del cerebro humano | Humano | Mesoscópico | Estructural | Saludable | No | ||
| Atlas de Kymata | Atlas funcional de la corteza humana | Humano | Macroscópico | Funcional | Saludable | No | ||
| Base de datos de neuroimagen del trastorno depresivo mayor | Metaanálisis y base de datos de estudios de resonancia magnética | Humano | Macroscópico | Descriptivo, numérico | Trastorno depresivo mayor | No | ||
| Atlas genético de titíes | Expresión genética en todo el cerebro del tití común | Tití común | Macroscópico, Gen | Imagenes | Saludable | No | ||
| Biblioteca de cerebro de ratón | Atlas, secciones teñidas de cerebros de ratón | Ratón | Macroscópico | Imagenes | Saludable | No | ||
| NeuroData | Conjuntos de datos volumétricos, atlas e investigación de la conectómica | Múltiple | Multiescala | Imágenes (3D, 4D) | Varios | No | ||
| Neuroelectro.org | Electrofisiología de neuronas | Humanos, otros | Neurona | Propiedades y datos electrofisiológicos | Saludable | No | ||
| Neuromorpho.org | Modelos 3D de neuronas reales | Humano, rata , ratón , mono , otros | Neurona | Imágenes y datos 3D | Saludable | No | ||
| Neuromorphometrics.com | Escáneres cerebrales de resonancia magnética etiquetados manualmente | Humano | Macroscópico | Resonancia magnética ponderada en T1, volúmenes etiquetados | Saludable | No | ||
| NeuronDB | Base de datos de propiedades y clasificación de neuronas | Humano | Neurona | Descriptivo | Saludable | No | ||
| Colaboración de recursos y herramientas de neuroimagen (NITRC) | Colaboración gratuita galardonada con más de 1000 herramientas de software de neuroinformática, conjuntos de datos de imágenes y recursos comunitarios, incluidos foros y eventos. | Humano, ratón, rata, otro | Microscópico, macroscópico | Conjuntos de datos | Sanos y enfermos | No | ||
| Serie de estudios de imágenes de acceso abierto (OASIS) | Imágenes de resonancia magnética estructural | Humano | Macroscópico | Conjuntos de datos de resonancia magnética | Enfermedad sana y de Alzheimer | sí | ||
| Abrir proyecto Connectome | Base de datos de diferentes marcos de circuitos y conjuntos de datos de neuroimagen, incluidos conjuntos de datos volumétricos, atlas e investigación de la conectómica | Humano, ratón, murciélago, pez cebra, insecto, otro | Multinivel: regiones cerebrales, conexiones, neuronas, patrones de expresión génica | Imágenes y datos 3D | Saludable | No | ||
| OpenNeuro | Colección amplia y diversa de datos brutos de varios estudios de investigación distribuidos bajo licencias permisivas ( CC0 y CC-BY ). Todos los conjuntos de datos tienen el mismo formato ( estructura de datos de imágenes cerebrales ) y se puede acceder a ellos a través de Amazon S3 . | Humano | Macroscópico | Conjuntos de datos de resonancia magnética funcional, estructural, de difusión y de magnetoencefalografía | Enfermedades sanas y diversas. | No | ||
| Abrir archivo MEG (OMEGA) | Magnetoencefalografía , conjuntos de datos de resonancia magnética estructural y datos demográficos | Humano | Macroscópico | MEG, conjuntos de datos T1 MRI, datos demográficos | Saludable, TDAH , lesión cerebral traumática | sí | ||
| El repositorio PAIN | Conjuntos de datos de resonancia magnética estructural, de difusión y funcional | Humano | Macroscópico humano | Conjuntos de datos y metadatos de resonancia magnética | Condiciones saludables y dolorosas | sí | ||
| Atlas del cerebro de cerdo | Pig Brain Atlas es un cerebro y atlas promediados basado en resonancia magnética tridimensional del lechón neonatal (Sus scrofa). | Cerdo (Sus scrofa) | Macroscópico | Resonancia magnética estructural | Saludable | sí | ||
| Base de datos de tipos de células de primates | PrimateDatabase.com, un archivo de acceso web accesible al público de grabaciones intracelulares de pinza de parche y reconstrucciones digitales tridimensionales altamente detalladas de la morfología neuronal. | Primate no humano y humano | Neurona | Electrofisiología, morfología y reconstrucciones tridimensionales | Saludable | No | ||
| SchizConnect | SchizConnect es una base de datos virtual abierta y pública de búsqueda y descarga de imágenes de neuroimagen (MRI) de esquizofrenia y datos relacionados. | Humano | Macroscópico | Conjuntos de datos de resonancia magnética estructural, de difusión y funcional, evaluaciones cognitivas y clínicas | Esquizofrenia (+ hermanos), Trastorno bipolar, Controles (+ hermanos) | sí | ||
| Base de datos de Temple EEG | Más de 30.000 electroencefalogramas clínicos e informes neurológicos adjuntos | Humano | Macroscópico | Electroencefalograma | Enfermedades sanas y diversas. | sí | ||
| Conjunto de datos de RM de cerebro completo ponderado en T1 de resolución ultra alta | Datos de RM ponderados en T1 adquiridos mediante corrección de movimiento prospectivo a una resolución isotrópica ultra alta de 250 µm. | Humano | Mesoscópico | Conjunto de datos de resonancia magnética estructural que incluye datos sin procesar a procesados del escáner | Saludable | No | ||
| Base de datos de resonancia magnética Rhesus del neurodesarrollo de UNC-Wisconsin | Imágenes de resonancia magnética ponderadas por difusión y estructural en el espacio nativo y Atlas | Macaco | Macroscópico | Conjuntos de datos de resonancia magnética | Saludable | No | ||
| Atlas del cerebro completo | Atlas, imágenes de resonancia magnética estructural e imágenes de PET | Humano | Macroscópico | Imagenes | Enfermedades sanas y diversas. | No | ||
| NeuroVault | Mapas estadísticos sin límites de estudios de resonancia magnética y PET. | Humano | Macroscópico | Imagenes | Enfermedades sanas y diversas. | No |
Bases de datos de bases de datos de neurociencias
| Nombre | Descripción | Organismo | Nivel (gen, neurona, macroscópico) | Datos (resonancia magnética, resonancia magnética funcional, imágenes, descriptivos, numéricos) | Trastorno | ¿Registrarse para ver los datos? | Árbitro. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Marco de información de neurociencia | Una metabase de datos de datos relevantes para la neurociencia que incorpora más de 100 bases de datos. | Humano, ratón, rata, gusano | Microscópico, macroscópico | Conjuntos de datos | Sanos y enfermos | No |
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