SPI1 - SPI1

SPI1
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	1PUE
Identificadores
Alias	Protooncogén SPI1 , OF, PU.1, SFPI1, SPI-1, SPI-A, Spi-1
Identificaciones externas	OMIM : 165170 MGI : 98282 HomoloGene : 2346 GeneCards : SPI1
Ubicación de genes ( humanos )
Chr.	Cromosoma 11 (humano)
Fin	47,378,547 pb
Ubicación de genes ( ratón )
Chr.	Cromosoma 2 (ratón)
Fin	91,115,756 pb
Patrón de expresión de ARN
	Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes
Función molecular	• la unión al ADN ; • de unión a ADN específica de secuencia ; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ADN vinculante actividad del activador de la transcripción, la ARN polimerasa II-específico ; • GO: 0000980 ARN polimerasa II cis- Unión de ADN específica de la secuencia de la región reguladora ; • Actividad del factor de transcripción , Unión específica de la secuencia de la región proximal del promotor del núcleo de la ARN polimerasa II ; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Unión de ADN Actividad represora de la transcripción, ARN polimerasa II específica ; • GO: 0001948 Unión a proteínas ; • Unión de ARN ; • Actividad del factor de transcripción , Unión específica de secuencia del potenciador distal de ARN polimerasa II ; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN ; • Unión a la proteína NFAT ; • GO: 0001200 , GO: 0001133, GO: 0001201 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN, específica de la ARN polimerasa II ; • unión al factor de transcripción;
Componente celular	• núcleo ; • nucleoplasma ; • complejo regulador de la transcripción;
Proceso biológico	• diferenciación de leucocitos mieloides ; • regulación de la transcripción, plantilla de ADN ; • respuesta celular al etanol ; • mantenimiento de la población de células madre somáticas ; • diferenciación de linfocitos ; • regulación de la diferenciación de eritrocitos ; • diferenciación de células dendríticas mieloides ; • regulación negativa de la transcripción por ARN polimerasa II ; • regulación negativa de MHC proceso biosintético de clase II ; • diferenciación de células progenitoras linfoides ; • transcripción, plantilla de ADN ; • diferenciación de macrófagos ; • regresión de la estructura anatómica ; • regulación negativa de la acetilación de la histona H4 ; • regulación negativa de la expresión génica, epigenética ; • desarrollo de la vasculatura ; • diferenciación de granulocitos ; • proceso apoptótico involucrado en los vasos sanguíneos morfogénesis ; • acetilación de la histona H3 ; • diferenciación de eritrocitos ; • hipermetilación de la isla CpG ; • regulación positiva de la transcripción de pri-miARN por la ARN polimerasa II ; • regulación positiva de la transcripción por la ARN polimerasa II ; • regulación negativa de la transcripción, D Plantilla de NA ; • regulación positiva de la transcripción, plantilla de ADN ; • regulación de la transcripción por ARN polimerasa II ; • transcripción de pri-miARN por ARN polimerasa II ; • diferenciación celular ; • vía de señalización mediada por interleucina-6;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	6688
	20375
	ENSG00000066336
	ENSMUSG00000002111
	P17947
	P17433
	NM_001080547 ; NM_003120
	NM_011355 ; NM_001378898 ; NM_001378899
	NP_001074016 ; NP_003111
	NP_035485 ; NP_001365827 ; NP_001365828
	Wikidata
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El factor de transcripción PU.1 es una proteína que en humanos está codificada por el gen SPI1 .

Función

Este gen codifica un factor de transcripción del dominio ETS que activa la expresión génica durante el desarrollo de las células mieloides y linfoides B. La proteína nuclear se une a una secuencia rica en purina conocida como PU-box que se encuentra en potenciadores de genes diana y regula su expresión en coordinación con otros factores de transcripción y cofactores. La proteína también puede regular el empalme alternativo de genes diana. Se han encontrado múltiples variantes de transcripción que codifican diferentes isoformas para este gen.

Estructura

El dominio ETS es el módulo de unión al ADN de PU.1 y otros factores de transcripción de la familia ETS.

Interacciones

Se ha demostrado que SPI1 interactúa con:

FUS ,
GATA2 ,
IRF4 y
NONO .

Referencias

Otras lecturas

Klemsz MJ, McKercher SR, Celada A, Van Beveren C, Maki RA (1990). "El factor de transcripción específico de macrófagos y células B PU.1 está relacionado con el oncogén ets". Celular . 61 (1): 113–124. doi : 10.1016 / 0092-8674 (90) 90219-5 . PMID 2180582 . S2CID 27819155 .
Nguyen VC, Ray D, Gross MS, de Tand MF, Frézal J, Moreau-Gachelin F (1990). "Localización del oncogén humano SPI1 en el cromosoma 11, región p11.22". Tararear. Genet . 84 (6): 542–546. doi : 10.1007 / bf00210807 . PMID 2338340 . S2CID 22337200 .
Chen H, Ray-Gallet D, Zhang P, Hetherington CJ, Gonzalez DA, Zhang DE, Moreau-Gachelin F, Tenen DG (1995). "PU.1 (Spi-1) autorregula su expresión en células mieloides". Oncogén . 11 (8): 1549-1560. PMID 7478579 .
Nagulapalli S, Pongubala JM, Atchison ML (1995). "Múltiples proteínas interactúan físicamente con PU.1. Sinergia transcripcional con NF-IL6 beta (C / EBP delta, CRP3)". J. Immunol . 155 (9): 4330–4338. PMID 7594592 .
Pongubala JM, Atchison ML (1995). "La activación del factor de transcripción 1 y el modulador del elemento de respuesta de AMP cíclico pueden modular la actividad del potenciador de inmunoglobulina kappa 3 '" . J. Biol. Chem . 270 (17): 10304–10313. doi : 10.1074 / jbc.270.17.10304 . PMID 7730336 .
Hromas R, Orazi A, Neiman RS, Maki R, Van Beveran C, Moore J, Klemsz M (1993). "Expresión restringida por linaje hematopoyético y etapa del miembro de la familia de oncogén ETS PU.1" . Sangre . 82 (10): 2998–3004. doi : 10.1182 / sangre.V82.10.2998.2998 . PMID 8219191 .
Hagemeier C, Bannister AJ, Cook A, Kouzarides T (1993). "El dominio de activación del factor de transcripción PU.1 se une a la proteína del retinoblastoma (RB) y al factor de transcripción TFIID in vitro: RB muestra similitud de secuencia con TFIID y TFIIB" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 90 (4): 1580-1584. Código bibliográfico : 1993PNAS ... 90.1580H . doi : 10.1073 / pnas.90.4.1580 . PMC 45918 . PMID 8434021 .
Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (1996). "El factor de transcripción Spi-1 / PU.1 se une al ARN e interfiere con la proteína de unión al ARN p54nrb" . J. Biol. Chem . 271 (19): 11177–11181. doi : 10.1074 / jbc.271.19.11177 . PMID 8626664 .
Bassuk AG, Anandappa RT, Leiden JM (1997). "Las interacciones físicas entre Ets y las proteínas NF-kappaB / NFAT juegan un papel importante en su activación cooperativa del potenciador del virus de la inmunodeficiencia humana en las células T" . J. Virol . 71 (5): 3563–3573. doi : 10.1128 / JVI.71.5.3563-3573.1997 . PMC 191503 . PMID 9094628 .
Li SL, Valente AJ, Zhao SJ, Clark RA (1997). "PU.1 es esencial para la actividad promotora de p47 (phox) en células mieloides" . J. Biol. Chem . 272 (28): 17802-17809. doi : 10.1074 / jbc.272.28.17802 . PMID 9211934 .
Tsukada J, Misago M, Serino Y, Ogawa R, Murakami S, Nakanishi M, Tonai S, Kominato Y, Morimoto I, Auron PE, Eto S (1997). "El impuesto del virus de la leucemia de células T humanas tipo I transactiva el promotor del gen de la prointerleucina-1beta humana mediante la asociación con dos factores de transcripción, el factor nuclear-interleucina-6 y Spi-1" . Sangre . 90 (8): 3142–3153. doi : 10.1182 / sangre.V90.8.3142 . PMID 9376596 .
Hallier M, Lerga A, Barnache S, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (1998). "El factor de transcripción Spi-1 / PU.1 interactúa con el factor de empalme potencial TLS" . J. Biol. Chem . 273 (9): 4838–4842. doi : 10.1074 / jbc.273.9.4838 . PMID 9478924 .
Suzuki S, Kumatori A, Haagen IA, Fujii Y, Sadat MA, Jun HL, Tsuji Y, Roos D, Nakamura M (1998). "PU.1 como activador esencial para la expresión del gen gp91 (phox) en neutrófilos, monocitos y linfocitos B periféricos humanos" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (11): 6085–6090. Código Bibliográfico : 1998PNAS ... 95.6085S . doi : 10.1073 / pnas.95.11.6085 . PMC 27589 . PMID 9600921 .
Carrère S, Verger A, Flourens A, Stehelin D, Duterque-Coquillaud M (1998). "Las proteínas Erg, factores de transcripción de la familia Ets, forman homo, heterodímeros y complejos ternarios a través de dos dominios distintos" . Oncogén . 16 (25): 3261–3268. doi : 10.1038 / sj.onc.1201868 . PMID 9681824 .
Sato M, Morii E, Takebayashi-Suzuki K, Yasui N, Ochi T, Kitamura Y, Nomura S (1999). "Factor de transcripción asociado a microftalmia interactúa con PU.1 y c-Fos: determinación de su localización subcelular". Biochem. Biophys. Res. Comun . 254 (2): 384–387. doi : 10.1006 / bbrc.1998.9918 . PMID 9918847 .
Latón AL, Zhu AQ, Singh H (1999). "Requisitos de ensamblaje de complejos activadores PU.1-Pip (IRF-4): función inhibidora in vivo utilizando dímeros fusionados" . EMBO J . 18 (4): 977–991. doi : 10.1093 / emboj / 18.4.977 . PMC 1171190 . PMID 10022840 .
Yamamoto H, Kihara-Negishi F, Yamada T, Hashimoto Y, Oikawa T (1999). "Interacciones físicas y funcionales entre el factor de transcripción PU.1 y el coactivador CBP" . Oncogén . 18 (7): 1495–1501. doi : 10.1038 / sj.onc.1202427 . PMID 10050886 .
Rao S, Matsumura A, Yoon J, Simon MC (1999). "SPI-B activa la transcripción a través de un dominio único de prolina, serina y treonina y exhibe diferencias de afinidad de unión al ADN de PU.1" . J. Biol. Chem . 274 (16): 11115-11124. doi : 10.1074 / jbc.274.16.11115 . PMID 10196196 .
Mao S, Frank RC, Zhang J, Miyazaki Y, Nimer SD (1999). "Interacciones funcionales y físicas entre las proteínas AML1 y una proteína ETS, MEF: implicaciones para la patogénesis de las leucemias t (8; 21) positivas" . Mol. Celda. Biol . 19 (5): 3635–3644. doi : 10.1128 / mcb.19.5.3635 . PMC 84165 . PMID 10207087 .

enlaces externos

FactorBook PU.1

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