eEF-1 - eEF-1
| Factor de alargamiento 1 beta región ácida central, eucariota | |||||||||
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| Identificadores | |||||||||
| Símbolo | EF1_beta_acid | ||||||||
| Pfam | PF10587 | ||||||||
| InterPro | IPR018940 | ||||||||
| INTELIGENTE | SM01182 | ||||||||
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| Factor de elongación de traducción EF1B, subunidad beta / delta, dominio de intercambio de nucleótidos de guanina | |||||||||
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| Identificadores | |||||||||
| Símbolo | EF1_GNE | ||||||||
| Pfam | PF00736 | ||||||||
| InterPro | IPR014038 | ||||||||
| INTELIGENTE | SM00888 | ||||||||
| CDD | cd00292 | ||||||||
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Los eEF-1 son dos factores de elongación eucariotas . Forma dos complejos, el homólogo EF-Tu EF-1A y el homólogo EF- Ts EF-1B , el factor de intercambio de guanida del primero. Ambos también se encuentran en arqueas .
Estructura
La nomenclatura de las subunidades eEF-1 ha cambiado un poco alrededor de 2001, ya que se reconoció que los complejos EF-1A y EF-1B son hasta cierto punto independientes entre sí. Los componentes tal como se reconocen y nombran actualmente incluyen:
| Nomenclatura actual | Nomenclatura antigua | Genes humanos | Función canónica |
|---|---|---|---|
| eEF1A | eEF1α |
EEF1A1 , EEF1A2 EEF1A1P43 |
entrega de aa-tRNA al ribosoma; se asocia con el complejo aa-tRNA sintasa. |
| eEF1Bα | eEF1β (animal, hongos) eEF1β ' (planta) |
EEF1B2 EEF1B2P1 , EEF1B2P2 , EEF1B2P3 |
GEF para eEF1A. |
| eEF1Bβ | eEF1β (planta) | (Ninguno) | GEF adicional para eEF1A en plantas con actividad controlada por CDF-quinasa. |
| eEF1Bγ | eEF1γ | EEF1G | Componente estructural. |
| eEF1Bδ | eEF1δ | EEF1D | GEF adicional para eEF1A en animales. |
| eEF1ε | eEF1ε | EEF1E1 | No es realmente un factor de alargamiento. Andamiaje para el complejo aa-tRNA sintasa. |
| Val-RS | Val-RS | VARS | Valil-tRNA sintetasa, se une a eEF1Bδ en conejos. |
La manera precisa en que la subunidad eEF1B se une a eEF1A varía según el órgano y la especie. eEF1A también se une a actina .
Otras especies
Varias especies de algas verdes , algas rojas , cromalveolatos y hongos carecen del gen EF-1α, pero en cambio poseen un gen relacionado llamado EFL (similar al factor de elongación). Aunque su función no se ha estudiado en profundidad, parece ser similar a EF-1α.
A partir de 2009, se sabe que solo dos organismos tienen EF-1α y EFL: el hongo Basidiobolus y la diatomea Thalassiosira . La historia evolutiva de EFL no está clara. Puede haber surgido una o más veces seguido de pérdida de EFL o EF-1α. Se supone que la presencia en tres grupos eucariotas diversos (hongos, cromalveolatos y archaeplastida ) es el resultado de dos o más eventos de transferencia genética horizontal , según una revisión de 2009. Un informe de 2013 encuentra 11 especies más con ambos genes y proporcionó una hipótesis alternativa de que un eucariota ancestro puede tener ambos genes. En todos los organismos conocidos en los que están presentes ambos genes, EF-1α tiende a reprimirse transcripcionalmente. Si la hipótesis es cierta, los científicos esperarían encontrar un organismo que tenga un EFL reprimido y un EF-1α en pleno funcionamiento.
Una revisión de 2014 de EF-1α / EFL que poseen eucariotas considera que ambas explicaciones son insuficientes por sí mismas para explicar la compleja distribución de estas dos proteínas en eucariotas.
En eucariotas, una GTPasa relacionada llamada eRF3 participa en la terminación de la traducción. El archaeal EF-1α, por otro lado, realiza todas las funciones llevadas a cabo por estas variantes subfuncionalizadas.
Ver también
Referencias
enlaces externos
- Péptido + Elongación + Factor + 1 en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .