Alameticina - Alamethicin

Alameticina

Nombres
Nombre IUPAC N -acetil-2-methylalanyl- L prolil-2-methylalanyl- L alanil-2-methylalanyl- L -alanyl- L -glutaminyl-2-methylalanyl- L valil-2-methylalanylglycyl- L leucil-2- methylalanyl- L prolil- L valil-2-metilalanilo-2-methylalanyl- L -α-glutamil N 1 - [(1 S ) -1-bencil-2-hidroxietil] - L -glutamamide
Identificadores
Número CAS
Modelo 3D ( JSmol )
CHEMBL
ChemSpider
Tarjeta de información ECHA	100.121.626
PubChem CID
UNII
Tablero CompTox ( EPA )
InChI EnChI = 1S / C92H150N22O25 / c1-47 (2) 43-58 (72 (127) 108-92 (24,25) 84 (139) 113-41-29-33-59 (113) 73 (128) 103- 65 (48 (3) 4) 75 (130) 111-90 (20,21) 82 (137) 112-89 (18,19) 80 (135) 102-56 (37-40-64 (120) 121) 70 (125) 101-55 (35-38-61 (93) 117) 69 (124) 98-54 (46-115) 44-53-31-27-26-28-32-53) 99-63 ( 119) 45-95-77 (132) 85 (10,11) 110-76 (131) 66 (49 (5) 6) 104-81 (136) 88 (16,17) 107-71 (126) 57 ( 36-39-62 (94) 118) 100-67 (122) 50 (7) 96-78 (133) 86 (12,13) ​​106-68 (123) 51 (8) 97-79 (134) 87 ( 14,15) 109-74 (129) 60-34-30-42-114 (60) 83 (138) 91 (22,23) 105-52 (9) 116 / h26-28,31-32,47- 51,54-60,65-66,115H, 29-30,33-46H2,1-25H3, (H2,93,117) (H2,94,118) (H, 95,132) (H, 96,133) (H, 97,134) (H , 98,124) (H, 99,119) (H, 100,122) (H, 101,125) (H, 102,135) (H, 103,128) (H, 104,136) (H, 105,116) (H, 106,123) (H, 107,126) (H , 108,127) (H, 109,129) (H, 110,131) (H, 111,130) (H, 112,137) (H, 120,121) / t50-, 51-, 54-, 55-, 56-, 57-, 58-, 59-, 60-, 65-, 66- / m0 / s1 Y Clave: LGHSQOCGTJHDIL-UTXLBGCNSA-N Y EnChI = 1 / C92H150N22O25 / c1-47 (2) 43-58 (72 (127) 108-92 (24,25) 84 (139) 113-41-29-33-59 (113) 73 (128) 103- 65 (48 (3) 4) 75 (130) 111-90 (20,21) 82 (137) 112-89 (18,19) 80 (135) 102-56 (37-40-64 (120) 121) 70 (125) 101-55 (35-38-61 (93) 117) 69 (124) 98-54 (46-115) 44-53-31-27-26-28-32-53) 99-63 ( 119) 45-95-77 (132) 85 (10,11) 110-76 (131) 66 (49 (5) 6) 104-81 (136) 88 (16,17) 107-71 (126) 57 ( 36-39-62 (94) 118) 100-67 (122) 50 (7) 96-78 (133) 86 (12,13) ​​106-68 (123) 51 (8) 97-79 (134) 87 ( 14,15) 109-74 (129) 60-34-30-42-114 (60) 83 (138) 91 (22,23) 105-52 (9) 116 / h26-28,31-32,47- 51,54-60,65-66,115H, 29-30,33-46H2,1-25H3, (H2,93,117) (H2,94,118) (H, 95,132) (H, 96,133) (H, 97,134) (H , 98,124) (H, 99,119) (H, 100,122) (H, 101,125) (H, 102,135) (H, 103,128) (H, 104,136) (H, 105,116) (H, 106,123) (H, 107,126) (H , 108,127) (H, 109,129) (H, 110,131) (H, 111,130) (H, 112,137) (H, 120,121) / t50-, 51-, 54-, 55-, 56-, 57-, 58-, 59-, 60-, 65-, 66- / m0 / s1 Clave: LGHSQOCGTJHDIL-UTXLBGCNBC
Sonrisas CC (C) C [C @@ H] (C (= O) NC (C) (C) C (= O) N1CCC [C @ H] 1C (= O) N [C @@ H] (C ( C) C) C (= O) NC (C) (C) C (= O) NC (C) (C) C (= O) N [C @@ H] (CCC (= O) O) C ( = O) N [C @@ H] (CCC (= O) N) C (= O) N [C @@ H] (CC2 = CC = CC = C2) CO) NC (= O) CNC (= O ) C (C) (C) NC (= O) [C @ H] (C (C) C) NC (= O) C (C) (C) NC (= O) [C @ H] (CCC ( = O) N) NC (= O) [C @ H] (C) NC (= O) C (C) (C) NC (= O) [C @ H] (C) NC (= O) C ( C) (C) NC (= O) [C @@ H] 3CCCN3C (= O) C (C) (C) NC (= O) C CC (C) CC (C (= O) NC (C) (C) C (= O) N1CCCC1C (= O) NC (C (C) C) C (= O) NC (C) (C) C ( = O) NC (C) (C) C (= O) NC (CCC (= O) O) C (= O) NC (CCC (= O) N) C (= O) NC (Cc2ccccc2) CO) NC (= O) CNC (= O) C (C) (C) NC (= O) C (C (C) C) NC (= O) C (C) (C) NC (= O) C (CCC ( = O) N) NC (= O) C (C) NC (= O) C (C) (C) NC (= O) C (C) NC (= O) C (C) (C) NC (= O) C3CCCN3C (= O) C (C) (C) NC (= O) C
Propiedades
Fórmula química	C 92 H 150 N 22 O 25
Masa molar	1964,31 g / mol
Apariencia	Sólido blanquecino
Punto de fusion	255 a 270 ° C (491 a 518 ° F; 528 a 543 K)
solubilidad en agua	Insoluble
Solubilidad en DMSO , metanol , etanol	Soluble
Salvo que se indique lo contrario, los datos se proporcionan para materiales en su estado estándar (a 25 ° C [77 ° F], 100 kPa).
norte verificar  ( ¿qué es   ?) Ynorte
Referencias de Infobox

La alameticina es un antibiótico peptídico formador de canales , producido por el hongo Trichoderma viride . Pertenece a los péptidos de peptaibol que contienen el residuo de aminoácido no proteinogénico Aib ( ácido 2-aminoisobutírico ). Este residuo induce fuertemente la formación de estructura alfa-helicoidal . La secuencia de péptidos es:

Ac-Aib-Pro-Aib-Ala-Aib-Ala-Gln-Aib-Val-Aib-Gly-Leu-Aib-Pro-Val-Aib-Aib-Glu-Gln-Phl

(Ac = acetilo, Phl = fenilalaninol , Aib = ácido 2-aminoisobutírico )

En las membranas celulares , se forma de voltaje dependientes de iones de canales por agregación de cuatro a seis moléculas .

Biosíntesis

Se plantea la hipótesis de que la biosíntesis de alameticina está catalizada por alameticina sintasa, una péptido sintasa no ribosomal (NRPS) aislada por primera vez en 1975. Aunque hay varias secuencias aceptadas del péptido de alameticina, la evidencia sugiere que todas siguen el mecanismo general de NRPS con pequeñas variaciones en aminoácidos seleccionados . Comenzando con la acilación del N terminal del primer ácido aminoisobutírico en la enzima ALM sintasa por Acetil-CoA , esto es seguido por la condensación secuencial de aminoácidos por cada unidad modular de la sintetasa. Los aminoácidos se adenilan inicialmente mediante un dominio de " adenilación " (A) antes de unirse mediante un enlace tioéster a una proteína transportadora de peptidilo similar a la proteína transportadora de acilo . La cadena en crecimiento se une al aminoácido que lleva PCP por el dominio de "condensación" (C), seguido de otra ronda de las mismas reacciones por el siguiente módulo.

El mecanismo general de síntesis de NRPS en alameticina, que muestra la condensación de sustratos de aminoácidos de un módulo a otro. Ac = Acetil Aib = ácido aminoisobutírico. Componentes del módulo: A = Adenililación PCP = Proteína portadora de peptidilo C = Condensación

El ensamblaje se completa con la adición de fenilalaninol, un inusual sustrato similar a un aminoácido. Después de la adición de fenilalaninol, la cadena peptídica completa es escindida por el dominio tioesterasa, escindiendo el enlace tioéster y dejando un alcohol.

Un diagrama de los módulos individuales y elongación de la biosíntesis de alameticina. La cadena de péptidos en crecimiento se muestra para cada módulo, terminando en la escisión del tioéster y la generación de alameticina lineal. Ac = Acetil Aib = Ácido aminoisobutírico Pheol = Fenilalaninol. Componentes del módulo: A = Adenililación PCP = Proteína portadora de peptidilo C = Condensación

Referencias

Otras lecturas

• Jones, LR; Maddock, SW; Besch, HR Jr (1980). "Efecto desenmascarador de alameticina sobre la (Na +, K +) - ATPasa, adenilato ciclasa acoplada al receptor beta-adrenérgico y actividades de proteína quinasa dependientes de AMPc de vesículas sarcolemáticas cardíacas" . J. Biol. Chem . 255 (20): 9971–9980. doi : 10.1016 / S0021-9258 (18) 43488-6 . PMID  6253461 .
• Explore las estructuras de alameticina en el banco de datos de proteínas
• Alamethicin en Norine
  • A partir de "Un modelo de canal iónico dependiente de voltaje inferido de la estructura cristalina de alameticina a una resolución de 1,5 A". Fox Jr., RO; Richards, FM (1982). "Un modelo de canal iónico dependiente de voltaje inferido de la estructura cristalina de alameticina a una resolución de 1,5 A". Naturaleza . 300 (5890): 325-30. Código Bibliográfico : 1982Natur.300..325F . doi : 10.1038 / 300325a0 . PMID  6292726 . S2CID  4278453 .
• Leitgeb, Balázs; Szekeres, András; Manczinger, László; Vágvölgyi, Csaba; Kredics, László (1 de junio de 2007). "La historia de la alameticina: una revisión del Peptaibol más ampliamente estudiado". Química y Biodiversidad . 4 (6): 1027–1051. doi : 10.1002 / cbdv.200790095 . ISSN  1612-1880 . PMID  17589875 . S2CID  40886688 .