Análisis de varianza molecular - Analysis of molecular variance
El análisis de varianza molecular ( AMOVA ), es un modelo estadístico para el algoritmo molecular en una sola especie , típicamente biológica . El nombre y el modelo están inspirados en ANOVA . El método fue desarrollado por Laurent Excoffier , Peter Smouse y Joseph Quattro en la Universidad de Rutgers en 1992.
Desde que desarrolló AMOVA, Excoffier ha escrito un programa para ejecutar tales análisis. Este programa, que se ejecuta en Windows , se llama Arlequin y está disponible gratuitamente en el sitio web de Excoffier. También hay implementaciones en lenguaje R en los paquetes ade4 y pegas, ambos disponibles en CRAN (Comprehensive R Archive Network). Otra implementación está en Info-Gen , que también se ejecuta en Windows . La versión para estudiantes es gratuita y completamente funcional. El idioma nativo de la aplicación es el español, pero también está disponible una versión en inglés.
Un paquete estadístico gratuito adicional, GenAlEx, está orientado tanto a la enseñanza como a la investigación y permite emplear y comparar análisis genéticos complejos dentro de la interfaz de Microsoft Excel de uso común. Este software permite el cálculo de análisis como AMOVA, así como comparaciones con otros tipos de estadísticas estrechamente relacionadas, incluidas las estadísticas F y el índice de Shannon, y más.
Referencias
- ^ Excoffier, L; Smouse, Pe; Quattro, Jm (junio de 1992). "Análisis de varianza molecular inferida de distancias métricas entre haplotipos de ADN: aplicación a datos de restricción de ADN mitocondrial humano" (Texto completo libre) . Genética . 131 (2): 479–91. ISSN 0016-6731 . PMC 1205020 . PMID 1644282 .
- ^ Peakall, R. y Smouse PE (2012) GenAlEx 6.5: análisis genético en Excel. Software de genética de poblaciones para la enseñanza y la investigación: una actualización. Bioinformatics 28, 2537-2539.
enlaces externos
- Sitio web de Arlequin 3
- Cálculo de AMOVA en línea para datos Y-STR
- Sitio web de Info-Gen
- Sitio web de GenAIEx
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